Mapas QGIS Históricos de Registos de Herpetofauna (no Missouri, EUA)

O Projeto Atlas Herpetológico do Missouri (MOHAP) foi iniciado em 1997 como resultado do desejo de obter e atualizar facilmente os mapas de distribuição pormenorizados para Missouri (Estados Unidos da América), de anfíbios e répteis. Uma base de dados foi criado para armazenar todas as localidades válidas, incluindo registos publicados em fontes bibliográficas históricas e espécimes referenciadas nos museus. A partir da base de dados, uma série de mapas podem ser produzidos representando ambos os registos de localidade e «registos do condado» para cada espécie.

MOHAP hospeda um site na http://atlas.moherp.org/ que descreve o projeto em detalhe e apresenta uma variedade de mapas estáticos, todos produzidos pelo QGIS. Está um atlas, publicado em formato PDF para transferência, é lançado periodicamente como uma publicação grátis tendo em conta o espírito do acesso aberto à investigação científica (Daniel, RE e BS Edmond. 2012. Atlas do Missouri de Anfíbios e Répteis para 2011. <http://atlas.moherp.org/pubs/atlas11.pdf>). Os mapas publicados são usados ​​por biólogos de campo, proprietários, e outros para entender melhor as distribuições das espécies no Missouri.

Em Fevereiro de 2013, a base de dados MOHAP continha 31.495 entradas representadas por espécimes armazenados em 34 coleções de museus e citado em 32 fontes históricas da literatura; 5118 registos documentados do condado; 6.884 localidades únicas, e 12.866 espécies / combinações de localidade . A herpetofauna do estado é composta por 113 espécies.

Gerar e Exportar Mapas Estáticos

O processo de criação de mapas com o QGIS começa com os dados guardados em várias tabelas do PostgreSQL, ativadas espacialmente com PostGIS. Porque os mapas são estáticos e finalmente destinados tanto para a Web ou um atlas impresso, estes são gerados automaticamente para cada espécie, utilizando um módulo QGIS Python personalizado (Figuras 1,2).

Custom map generation and export user interface

Geração de mapa personalizado e a interface de exportação, os mapas são gerados e exportados num processo em conjunto de exportação.

Os mapas finas das espécies tinha uma aparência simples e profissional (Figura 3). Para uma melhor compreensão das distribuições das espécies, foram criados e etiquetados uma série de mapas base (Figura 4). Devido à maneira como são geridos os estilos dentro de cada camada de dados, as camadas do mapa de base também podem ser incorporadas num conjunto de mapas das espécies com um pequeno esforço extra.

Mapas

Os mapas são dispostos em imagens estáticas.

Labelled Level III Ecoregion map for Missouri

Nível de rotulagem III Mapa de Eco-região para o Missouri e Estados limitrofes

Conclusões

No início do projeto MOHAP, várias ferramentas comerciais e proprietárias foram usadas ​​para armazenar e processar dados e produzir mapas para publicação. A partir de 2007, começámos a mover todos os aspetos do projeto para software de código aberto. O QGIS, junto com PHP, PostgreSQL, PostGIS, Python, e ReportLab, formam o eixo de código aberto para MOHAP, permitindo efetivamente que o projeto e todos os dados existirem livre de embaraços de software proprietário.

O QGIS contém suporte nativo para o PostGIS e uma arquitetura de módulos Python, que foram fundamentais na criação do mapa geração automatizada e exportação. A documentação da API extensa foi utilizada juntamente com o livro de programador de módulos para criar exatamente o que precisávamos para a automatização. O apoio da comunidade também é muito bom e inclui uma grande variedade de módulos construídos e compartilhados prontos para usar.

Apesar de usarmos o QGIS numa pequena forma e específica, as suas capacidades e extensibilidade usando Python é mais do que suficiente para lidar com projetos maiores e mais complexos.

Autor

Brian Edmond

Brian Edmond

Este artigo foi contribuído pelo Brian Edmond em Fevereiro de 2013. Ele é Analista Sénior de Sistemas em Serviços Computacionais na Universidade do Estado do Missouri. Ele possui uma licenciatura em Biologia de Vida Selvagem da Universidade do Missouri e investiu a sua carreira na zona integrada entre a biologia e tecnologia.