A QGIS és a GRASS alkalmazása egy biogeográfiai kutatásban az Ibériai-félszigeten

10 éve kezdtem el a GIS technológiák alkalmazását a biogeográfiai kutatásaimban. A tanulmányi áthallgatások, a doktori kutatások és másik két kutatási munka során felhasználtam a megfelelő szoftver csomagokat, amelyeket ezeken a munkahelyeken használtak, főleg CartaLinx, Idrisi, ArcView and ArcGIS. Sokszor bosszantónak találtam, hogy licenc megújítással kellett bajlódni folyamatosan és nem tudtuk a szoftvereket használni a munkahelytől távol, anélkül hogy saját felhasználású licencet kértem volna.

Distribution of Spanish algyroides

Spanyol hüllők (Algyroides marchi) előfordulása három különböző léptékben és két különböző adatforrás felhasználásával.

Sokszor elgondolkodtam azon, hogy a nyílt forráskódú eszközök használatával megszabadulhatok ezektől a problémáktól. Azonban, előítélet volt az ingyenes szoftverek elemzési képességeit tekintve és még azután is hogy hallottam a GRASS lehetőségeiről még mindig elutasító voltam és azt gondoltam, hogy túl bonyolult lenne megtanulni. Attól is féltem, hogy túl nehézkes lenne a térképek és az elemzési műveletek migrálása, amelyeket már elkészítettem. 2008 elején a posztdoktori képzésem lekezdésekor végül adtam egy lehetőséget és elmentem egy QGIS és GRASS képzésre. Talán ez volt az életem legjobb döntése! Megismertem, hogy a QGIS biztosít egy nagyon intuitív felhasználói felületet a GRASS-hoz és mindenben kiegészítették egymást ezáltal biztosítottak mindent amire szükségem volt az elemzéseimben.

Mindkét programot elkezdtem rögtön használni a képzés után. Nem csak az új GIS művelteimet kezdtem el QGIS/GRASS segítésével [pl. 1, 2], de a korábbi kereskedelmi szoftverek felhasználásával készült más műveletek is. Például, készítettem vidra[3] és pézsmacickány [4] előfordulási elemzéseket az Ibériai-félszigeten. Miután átálltam a QGIS/GRASS használatára teszteltem, hogyan tudom az így elkészített modelleket nagyobb felbontásban is futtatni [5]. Egy másik korábbi munkát a hiúz és a nyúl biogeográfiai kapcsolatának [6] elemzésében is folytattam miután átváltottam a QGIS/GRASS használatára [7]. Azon túl, hogy nem találtam problémát a migrációban de azt is tapasztaltam, hogy sokkal könnyebb műveleteket létrehozna az új szoftverkörnyezetben és további elemzési lehetőséket is tudtam használni amelyek a másik szoftverben nem voltak adottak.

Environmental suitability for the Pyrenean desman

Környezeti alkalmasság vizsgálatok a pireneusi pézsmacickány (Galemys pyrenaicus) előfordulásában, eltűnésében és véletlen feltűnési pontjaiban Észak-Katalónia (Spanyolország) területén

Következtetés

Összességében, a QGIS/GRASS használatára történő átállás csak előnyökkel járt a számomra. Most már szabadon tudok dolgozni a munkahelyemen, otthon és a saját laptopomon a terepen is, vagy másik intézménybe kerül estén minden aggodalom nélkül a szoftverlicencelés terén. A nyílt forráskódú szoftverek teljesen lefedik a kutatásomhoz szükséges eszközöket és megadják azt a szabadságot amire vágytam.

Hivatkozások

  • [1] Barbosa A.M., Fontaneto D., Marini L. & Pautasso M. (2010) Is the human population a large-scale indicator of the species richness of ground beetles? Animal Conservation, early view. doi: 10.1111/j.1469-1795.2010.00363.x.

  • [2] Fontaneto D., Barbosa A.M., Pautasso M. & Segers H. (submitted) The «rotiferologist» effect and the drivers of species richness in rotifers.

  • [3] Barbosa, A.M., R. Real, J. Olivero & J.M. Vargas, 2003. Otter (Lutra lutra) distribution modeling at two resolution scales suited to conservation planning in the Iberian Peninsula. Biological Conservation, 114:377-387.

  • [4] Barbosa A.M., Real R. & Vargas J.M. (2009) Transferability of environmental favourability models in geographic space: the case of the Iberian desman (Galemys pyrenaicus) in Portugal and Spain. Ecological Modelling 220: 747-754. doi: 10.1016/j.ecolmodel.2008.12.004

  • [5] Barbosa A.M., Real R. & Vargas J.M. (2010) Use of coarse-resolution models of species» distributions to guide local conservation inferences. Conservation Biology, early vew. doi: 10.1111/j.1523-1739.2010.01517.x

  • [6] Real R., A. M. Barbosa, A. Rodríguez, F. J. García, J. M. Vargas, L. J. Palomo & M. Delibes, 2008. Conservation biogeography of ecologically-interacting species: the case of the Iberian lynx and the European rabbit. Diversity and Distributions, 15: 390–400. doi: 10.1111/j.1472-4642.2008.00546.x.

  • [7] Barbosa, A.M. & Real, R. (in press) Favourable areas for expansion and reintroduction of Iberian lynx accounting for distribution trends and genetic diversity of the European rabbit. Wildlife Biology in Practice.”

Szerző

A. Márcia Barbosa

A Márcia Barbosa

Ez a cikk A. Márcia Barbosa közreműködésével készült 2010. júliusban. A. Márcia Barbosa posztdoktori kutató az Imperial College Londonban (Nagy-Britannia) és Évórai Egyetemen (Portugália).