QGIS Mapea Registros Históricos de Herpetofauna (en Missouri, EE.UU.)

El Proyecto del Atlas Herpetológico de Missouri (MOHAP) se inició en 1997 como resultado del deseo de obtener y actualizar fácilmente mapas de distribución detallados para los anfibios y reptiles de Missouri (Estados Unidos de América). Se estableció una base de datos para almacenar todas las localidades válidas, incluidos los registros publicados en fuentes de literatura histórica y especímenes validados de museos. A partir de la base de datos, se pueden producir una serie de mapas que representan tanto los registros locales como los «registros de condado» para cada especie.

MOHAP alberga un sitio web en http://atlas.moherp.org/ que describe el proyecto en detalle y muestra una variedad de mapas estáticos, todos elaborados en QGIS. Un atlas, publicado como PDF descargable, se publica periódicamente como una publicación gratuita con el espíritu de acceso abierto a la investigación científica (Daniel, RE y BS Edmond. 2012. Atlas de Missouri Anfibios y Reptiles para 2011. <http: // atlas .moherp.org / pubs / atlas11.pdf>). Los biólogos de campo, los administradores de tierras y otras personas utilizan los mapas publicados para comprender mejor la distribución de las especies en Missouri.

A partir de febrero de 2013, la base de datos MOHAP contenía 31,495 entradas que representan los especímenes alojados en 34 colecciones de museos y citados en 32 fuentes de literatura histórica; 5,118 registros documentados del condado; 6.884 localidades únicas; y 12,866 combinaciones únicas de especie / localidad. La herpetofauna del estado consta de 113 especies.

Generar y Exportar Mapas Estáticos

El proceso de creación de mapas con QGIS comienza con los datos almacenados en varias tablas de PostgreSQL, habilitados espacialmente con PostGIS. Debido a que los mapas son estáticos y, en última instancia, están destinados a la web o a un atlas impreso, se generan automáticamente para cada especie utilizando un complemento personalizado en Python de QGIS(Figuras 1,2).

Interfaz de usuario personalizada para la generación y exportación de mapas

Interfaz de usuario para personalizar la generación y exportación de mapas, los mapas son generados y exportados en un proceso batch.

Los mapas finales de especies tienen una clara apariencia profesional (Figura 3). Para un mejor entendimiento de la distribución de especies, una serie de mapas base son creados y etiquetados (Figura 4). Debido a que los estilos de forma son manejados dentro de cada capa de datos, las capas del mapa base pueden también ser incorporadas en un grupo de mapas de especie con un poco más de esfuerzo.

Mapas

Los mapas se muestran como imágenes estáticas.

Mapa etiquetado de la ecorregión de nivel III de Missouri

Mapa Etiquetado Nivel III de Ecorregión para Missouri y estados vecinos.

Conclusiones

Al comienzo del proyecto MOHAP, se utilizaron varias herramientas comerciales y propias para almacenar, procesar datos y producir mapas para su publicación. A partir de 2007, nos propusimos trasladar todos los aspectos del proyecto al software de código abierto. QGIS, junto con PHP, PostgreSQL, PostGIS, Python y ReportLab, forma el eje de código abierto para MOHAP, lo que permite que el proyecto y todos los datos coexistan sin enredos de software privativo.

QGIS contiene soporte nativo para PostGIS y una arquitectura de complementos de Python, que fueron esenciales para crear la generación y exportación de mapas automatizados. Se utilizó la extensa documentación de la API junto con el libro de cocina del desarrollador de complementos para crear exactamente lo que necesitábamos para la automatización. El soporte de la comunidad también es muy bueno e incluye una gran variedad de complementos compartidos creados y listos para usar.

Aunque usamos QGIS de un modo breve y específico, sus capacidades y extensibilidad con Python son más que suficientes para abordar proyectos más grandes y complejos.

Autor

Brian Edmond

Brian Edmond

Brian Edmond contribuyó con este artículo en febrero de 2013. Es analista de sistemas sénior en servicios informáticos en la Universidad Estatal de Missouri. Tiene una licenciatura en Biología de Vida Silvestre de la Universidad de Missouri y ha pasado su carrera en la zona intergrada entre biología y tecnología.